These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7927#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 971 fasta sequence [TTTTCATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCAATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAATCAGTATCATGAATAAAAGTATTTCGTTCATGTAAATGATGAGATGTATCAGGTGTTGTAGTTGTAGTAGTTTTTGAACCAATTGGTTCATATGAA] [-] EMBL CD064855 [TTTTCATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTAATAATGTATGGTGGATAGATGAAT ] [+] EMBL CD147217 [ CATATCACAAGCAACTGTATCAAATCCGTTTGATGACTGCGACTCTGTTGAACATGTATAAGGTCTTTTTGGTGGCATTAGATGAGATTCATTTGTTGGTAGTTCAGTATGCACAAAATGACTATTGTCCAGTAGATGAGTATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCAATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAANAAGGTGTT ] [-] EMBL CD147594 [ ATCACGATGACGTCGAGTCATGCAAGCACGTTTAGTATCTGTATCATCCATAGGTGTTAAAATATTTGAAGTTTCTTCTTCTTCAACTCCTCTTAGTTTACATGCTGGTCTGAAATAATGATCACTGGACATGATAGACCTAGGACTTAAAATATGTGACTTTTCTGTCTTCCCAGGACCATATGTATATTGTTCAATTGGATTTAATTGAATATCTGATAATGTATGGTGGATAGATGAATCAGAAGCAGTCCTGCGCCGATCAACCACTGAATACGGTGTTTGAGCCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTC ] [+] EMBL CD156737 [ CCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGGTGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAAT ] [+] EMBL CD156649 [ CCTGCCTAATCTGTTCAGTAATATTAGCAGAAAAAGGTGTTTTCAATTGGTGTTGTAAAGAATTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTG ] [+] EMBL CD147122 [ TTTGTAGGAGGAAAACTTCGAAATCCAACTGGTGTGCCGATACCAGCACTAAAATAACCTGATTCACATGTATATTGACTTGAATTAGTTAATGATGATTGTTGCGTAAGTAAACTGGTAGTGGATGCCACTTCAATATCTGAATGAGATGTACAAAATAGATAAGGATTTGTAGAAATATGTGATTTCGGTTGTAAACTTTGATAGTACGGTTTAGTATCTGTAAATAAATTAAAATTCCTTTGAATTTGATGCCGGCTAACAACTGCAACATTGGAACACTCATTGTTCCAATTATCTAAACAACTTTTAGGAGCAGAATGTTGTGTAGGTGGAATAGTAGACCAAGAGGATGACAAGTAATTATCAGATGATGCATAATCAGTATCATGAATAAAAGTATTTCGTTCATGTAAATGATGAGATGTATCAGGTGTTGTAGTTGTAGTAGTTTTTGAACCAATTGGTTCATATGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||