These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8142#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 697 fasta sequence [GGTTTAGCTATACATTTACTTGGTACATTAGCATTACTTTATTATGCAGTAACAAGAAAGAATCCATTTGTATTCTACAAGGGTTTATTTCAAGCTTGGATTACAGCACTTGGTACTGCATCCAGTGCAGCTACTCTACCAATCACATTTCG-TTGTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGATGCAGTTGGTGCTGGTATAGTGAATCATTTATGTTCTAAAGAATTAGCACAAAAAGATGCTGAAATTGATAAAGAAATTGATGAAGTTGTAGAAGAATATACACGTGAATTATCTAATACAACATCTATGATTGATCGTGAAAAACGTAACTCGTCTAGTTTAAATCGTCATCATAAAAAACGTATGAGTTTAGCTGCTGCTATAC] [+] EMBL CD080077 [GGTTTAGCTATACATTTACTTGGTACATTAGCATTACTTTATTATGCAGTAACAAGAAAGAATCCATTTGTATTCTACAAGGGTTTATTTCAAGCTTGGATTACAGCACTTGGTACTGCATCCAGTGCAGCTACTCTACCAATCACATTTCG TTGTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGATGCAGTTGGTGCTGGTATAGTGAATCATTTATGTTCTAAAGAATTAGCACAAAAAGATGCTGAAATTGATAAAGAAATTGATGAAGTTGTAGAAGAATATACACGTGAATTATCTAATACAACATCTATGATTGATCGTGAAAAACGTAACTCGTCTAGTTTAAATCGTCATCATAAAAAACGTATGAGTTTAGCTGCTGCTATAC] [-] EMBL CD070317 [ GTACTGCATCCAGTGCAGCTACTCTACCAATCACA TTCGTTTGTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGACCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGATGCA ] [-] EMBL CD070203 [ ACTCTACCAATCACATTTCG TGTTTTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTCGGACTGCCTACAAGAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT ] [-] EMBL CD070357 [ ACATTTCG TTGTTTAGAACAAAGTCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTNTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGTAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT ] [-] EMBL CD070283 [ CATTTCG TTG TTAGAACAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACGTTTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTTTATTGCACAAATTAATGGAAAATATTTGACCATTATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTAGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT ] [-] EMBL CD070385 [ CAAAATCTAGGCATTGATAAACGTGTAACACG TTTGTTTTACCTATTGGTGCAACAATCAATATGGATGGTACTGCATTATATGAAGCTGTGGCATCCATTTNTATTGCACAAATTAATGGAAAGTATTTGACCATCATTGAAGTATTCATTGTAAGCTTAACGGCAACGTTGGCAGCAATAGGTGCAGCTGGTGTTCCAAGTGCTGGTTTAGTCACTATGATGTTAGTGCTTACATCTGTTGGACTGCCTACAAAAGATATTTCTTTAATTTTAGCTGTTGATTGGTTACTTGATCGTATTCGTACATCAATCAATGTAATGGGTGAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||