These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8372#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1180 fasta sequence [ATAAGTCTGTCGACATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATG-CACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCGCGGCATTTGCAAGAACTGGCTACACATTTTTTGTACCTCCCAACCACCTATATTGAATCGACCAAATGTAGCAGAAATTGATATGTGGGAAATATCTTATAATGGCAAACCTATCAAACACCGTCAGACATCAAATTTGCGCTCTGGATCCAATAATTACAAACTTCCTGATACTTTTAAATCATCTAAAAACCCGGTTGATATTGTTAAACAGAAAGAAGTCGTTTGTGAAAAAGTGGATTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTTTGATCCACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAATTCTCTTTCACCCAACCCACAATCAAAAGTTTTATCCCTTAAAGAGTTTTCAAATGCAACCTCCACCAATGAAAACCTTATGTCTAGATCTCAATCTCCTGTTTTTGGAAGGACTGGAGAATTAAATAAGACAAATTCAAGTCTTGCTTTAGGAGGAACAAAGTCAAAGTCTTTAGGTAACAAAGATCAAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAAAAAGTGATCATTTAACTCCACTTCTATGATCTCAAGCGTATTCGGACGTTGATTTAATTCGG] [-] EMBL CD167191 [ATAAGTCTGTCGACATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAACC CACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAAC ] [-] EMBL CD167164 [ CATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAANATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATG AACAGCTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCGCGGCATTTGCAAGAACTG ] [-] EMBL CD167166 [ AAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATGCCAC GGTCA ] [-] EMBL CD200875 [ GGACGAACTCCAAATG AACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCCGGGCATTTGCAAGAACTGGCTACACATTTTTTGTACCTCCCAACCACCTATATTGAATCGACCAAATGTAGCAGAAATTGATATGTGGGAAATATCTTATAATGGCAAACCTATCAAACACCGTCAGACATCAAATTTGCGCTCTGGATCCAATAATTACAAACTTCCTGATACTTTTAAATCATCTAAAAACCCGGTTGATATTGTTAAACAGAAAGAAGTCGTTTGTGAAAAAGTGGATTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTTTGATCCACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAAT ] [+] EMBL AI067521 [ TTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTCTGATCAACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAATTCTCTTTCACCCAACCCACAATCAAAAGTTTTATCCCTTAAAGAGTTTTCAAATGCAACCTCCACCAATGAAAACCTTATGTCTAGATCTCAATCTCCTGTTTTTGGAAGGACTGGAGAATTAAATAAGACAAATTCAAGTCTTGCTTTAGGAGGAACAAAGTCAAAGTCTTTAGGTAACAAAGATCAAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAAAAAGTGATCATTTAACTCCACTTCTATGATCTCAAGCGTATTCGGACGTTGATTTAATTCGG] [-] EMBL CD167160 [ AAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAACCAGCGATCATTTAACTCCACTTCTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||