These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8438#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 776 fasta sequence [TCCATATAAAGGACATGGTGCACCTCTTACAGCCATCTCTACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGCGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGCCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAGTATAGGAGTCCCGCTTAAAAATAACAACTTTAAAAGGCTGTGTTGGGTTCCCTTATTTTCTTTTT] [-] EMBL CD160157 [TCCATATAAAGGACATGGTGCACCTCTTACAGCCATCTCTACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGCGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGCCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAA ] [-] EMBL CD160175 [ TACTCATCCAAGTCCTGGTGCTTTTAGTTTTTCATCGCTATTTCTCACTGCATCATTAGATTGGACTGTACGTTTATGGTCTACACGTGAACATAAACCTATACATACATTTGATGATTATTCGGATTATGTGTATGATGTATGCTGGAGTCCTGTACATCCAGCTGTATTTTCTGCTGTTGATGGTACTGGAAATTTAGATATATGGGATATGAATCAAGATGCTGAAATTCCTGTGGCTCGTCGCAAATTAGGATTATCAAGCAATGTAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAA ] [+] EMBL CD135302 [ TAGACACATCTTCATCGTCATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAtt ] [+] EMBL CD159528 [ CATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATTTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCGTTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAG ] [+] EMBL CD159539 [ CATCATCGAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAG ] [+] EMBL CD111389 [ GAATCTAGTCGGTGTTGCTTTAAATAAATGTCGTTGGAATACTGCGGGCACACATGTAGCTGTTGGAGATGATACCGGTCGTGTTACTGTTTGTAGTGTTCACGAAAGTCTTTCTCAGCCTGTCACTGATGATTGGTCTAGTTTCGCACATGTATTAGCTGATCTTAAACACTATGAAATGGAACCAGAAGTAGAAACAGAAGCATAATCTTGGTTAAAGGCCTAATTTTCTCTGTTTTTTGTATTTCTATGAATCATACATACCTCTTCTATGTAACACCAATCAGCTTCAATTTTATTTTACGTTGTTTTGAGAATTGAAGTTGCATTTGTAAGTTGACATATTTGGTTTTCATGAAAATTAATAAAGTACTTCAGTATAGGAGTCCCGCTTAAAAATAACAACTTTAAAAGGCTGTGTTGGGTTCCCTTATTTTCTTTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||