These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8519#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 858 fasta sequence [TCGACAGCATCAGAGTTCGTTACCGAGAAGGGTATTTCCACGGGAATGTGGCCGCAACTGGCTATCTTGATGCTCTTAACAGGTCTATCTCTTGAATCCGTCGTTTCACTTTCAATCTGTCTAACAATGTTCATTCCTTCTACAACTTTTCCGAAAACAACATGCTTTCCATCTAACCACGAGGTCTTCACGGTCGTAATAAAGAATTGGCTTCCATTTGTATCAGGACCAGACACAAGATAGCTTTTTCTGCTGGTTTACAGATGAATCCTCAGTGTTCGGCGACGAGCTGGGTGAAGTAATAAAGGACGACATTTGGCCTAATCCACTGCAATATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGAAAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT-TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGATAGTTCTTATTCTAAAACTCGAAATCAT] [+] EMBL CD137174 [TCGACAGCATCAGAGTTCGTTACCGAGAAGGGTATTTCCACGGGAATGTGGCCGCAACTGGCTATCTTGATGCTCTTAACAGGTCTATCTCTTGAATCCGTCGTTTCACTTTCAATCTGTCTAACAATGTTCATTCCTTCTACAACTTTTCCGAAAACAACATGCTTTCCATCTAACCACGAGGTCTTCACGGTCGTAATAAAGAATTGGCTTCCATTTGTATCAGGACCAGACACAAGATAGCTTTTTCTGCTGGTTTACAGATGAATCCTCAGTGTTCGGCGACGAGCTGGGTGAAGTAATAAAGGACGACATTTGGCCTAATCCACTGCAATATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGANAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACA ] [+] EMBL CD136999 [ aCATTTG AGGACCAGACACAAGATAGCTTTTTCTGCTGGTTTACAGATGAATCCTCAGTGTTCGGCGACGAGCTGGGTGAAGTAATAAAGGACGACATTTGGCCTAATCCACTGCAATATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGAAAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTGTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGNAGTCATATCTCAAACTTTGTTTC ] [-] EMBL CD161496 [ TATTACCTCTCACCAGATTTAGACGAAGAAAATGAAAACGATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAAT ] [+] EMBL CD136721 [ ATGAAGAGGATGAAGATGACGATGATGATCAGGATCTCGACGAGGATGAAACTGGTGTAGCGGATGTTTAAAGATCATTGCAATATATCATTTCCATTTAAACTTCAATCTTTGTTTCCCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTNTGTTTCT ] [-] EMBL CD136682 [ CCAAACGTGTATGTCTTCGCATGGAACAATATTGATACATTTGATTTGT TGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGc ] [-] EMBL CD165239 [ agCAATATGNATACA TTGA TTGTNNGTACAATGGCAAAAACAGACTGTTTCCACTTGTATATCGCGCCCCGGTTTTATGTTCCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTATTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGATAGTTCTTATTCTAAAACTCGAAATCAT] [-] EMBL CD165153 [ GCCCCGGTTNTATGTCNCACTCTTGAATACGCCTTTGTGTCATTTTGCATTTAATTGTAGCTATCGTCATACCGAGGCATATTCATGTGTCATGTGTTGGCTTTAACTTGACTGTTTTTATCCAGGGATCAGCGTTTTTGCCGTTGTTTCTGTTCCAGCCGCTATGCGTCTTAAGATTTTTGTATCAACACTTTTCGAGACGTGAGGTCATATCTCAAACTTTGTTTCTAATAAACAGTTATGAAGGATAGTTCTTACTCTAAAACTCGAAATCAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||