These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8902#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 690 fasta sequence [TATTTTGACGAAAGGATTAGTTAGTGCTTTTATTTTCACTC-CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA-TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTCACCTGATAACAGTGGAAATCTATTTTGTGGTGGGAACGAAGGTTTACTATACACTGCTAATATACAATCCCAAACGGGTTGTTATTCTGCGGATAGGAAATACACCNGTGTTTCTCTGACTCCAATTTTTCAGCTTCACAAAAAGCAAATACTATGATGGCGATGGATCCNAATTGTGAAAGT] [+] EMBL CD150338 [TATTTTGACGAAAGGATTAGTTAGTGCTTTTATTTTCACTC CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCT ] [-] EMBL CD144183 [ ATTTTGACGAAAGGATTAGTTAGTGCTTTTA TTTCACTCNNCGATGGAAATTATA TATCATTGCATTTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTNGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGGCCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTTGTGGG ] [+] EMBL CD118014 [ ATTAGTTAGTGCTTTTATTTTCACTC CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTC ] [+] EMBL CD084088 [ acgaggTCACTC CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTG ] [+] EMBL CD155406 [ GAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTC ] [-] EMBL CD200367 [ ggAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGctg ] [+] EMBL CD182207 [ TACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGACCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTCACCTGATAACAGTGGAAATCTATTTTGTGGTGGGAACGAAGGTTTACTATACACTGCTAATATACAATCCCAAACGGGTTGTTATTCTGCGGATAGGAAATACACCNGTGTTTCTCTGACTCCAATTTTTCAGCTTCACAAAAAGCAAATACTATGATGGCGATGGATCCNAATTGTGAAAGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||