These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8926#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 974 fasta sequence [CATCACGTGATGAGAACCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTA-TTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACGGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTACCATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG-TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAA-TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTTTCCTAATCATCAGGAGGGAGAAAGAGGAGAAGAGAGAGCAATATTGAAAGTGAATAAAAATAATAAATATCAATTATGCTATTTATTAAAACAATATCCTTNC] [-] EMBL CD127110 [CATCACGTGATGAGAACCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTA TTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACGGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTACCATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTGTTTTTTTAACTTTTATCTGCTTA ] [-] EMBL CD166887 [ aCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTATTTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACTGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTAACATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCNTAAATGATATAAGT AGAATGAG AAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCAT AAAATACACAAANAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGGATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGT ] [+] EMBL CD186920 [ GGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTT ] [+] EMBL CD091425 [ TAAAAATACACAAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAA TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTTTCCTAATCATCAGGAGGGAGAAAGAGGAGAAGAGAGAGCAATATTGAAAGTGAATAAAAATAATAAATATCAATTATGCTATTTATTAAAACAATATCCTTNC] [-] EMBL SMRAP019 [ gbyAGTTGACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATAMASATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTA ] [+] EMBL SM3741 [ AACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTT ] [-] EMBL CD201309 [ ATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCGA TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTT ] [+] EMBL AI618820 [ TTTATCTGCTTATTTTTAATAACGTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAAGTCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||