These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9196#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 480 fasta sequence [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTCC] [+] EMBL CD071620 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTNTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTCC] [+] EMBL CD071732 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTT ] [+] EMBL CD071524 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACGTAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAACTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATT ] [+] EMBL CD071640 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT ] [+] EMBL CD071625 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGCTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT ] [+] EMBL CD071592 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGCACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT ] [+] EMBL CD071575 [cGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCACTTTATCAAACTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCGTTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATAGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTNTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTC ] [-] EMBL CD118263 [ CACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGT AACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGATTTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||