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Schistosoma mansoni
cluster # 9196 cluster # 9196       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9196#0 length = 480 sequences # 8  

consensusID : consensus_9196#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 480
fasta sequence
                              [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTCC]

[+] EMBL CD071620             [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTNTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTCC]
[+] EMBL CD071732             [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD071524             [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACGTAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAACTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATT            ]
[+] EMBL CD071640             [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT             ]
[+] EMBL CD071625             [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGCTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT             ]
[+] EMBL CD071592             [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGCACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT             ]
[+] EMBL CD071575             [cGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCACTTTATCAAACTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCGTTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATAGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTNTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTC ]
[-] EMBL CD118263             [                                     CACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGT AACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGATTTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAG                                   ]


>consensus_9196#0 GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCA GTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAA CAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATC AAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACA GTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTA CAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAAT TTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGC ATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)