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Schistosoma mansoni
cluster # 9638 cluster # 9638       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9638#0 length = 577 sequences # 10  

consensusID : consensus_9638#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 577
fasta sequence
                              [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG-AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTTTCTCAATTTATCTGTACAAC]

[+] EMBL CD116218             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCGGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTTTCTCAATTTATCTGTACAAC]
[+] EMBL CD154514             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTNTCTCAATTTATCTGT     ]
[+] EMBL CD154512             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGCTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTTTCTCAATTTATC        ]
[+] EMBL CD116195             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACCAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGNTCATTT AATTTTCTCAATTat          ]
[+] EMBL CD116069             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCGGAATCTCAGAGAAAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD116101             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGGG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD154382             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAgt                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD154720             [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD154447             [TCTGGATGTGTACTGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD116196             [ CTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGT GTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATA                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_9638#0 TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAAT CTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAAT GTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGA TATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAA TCTCAGAGAAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGA TGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGT CGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTG ATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTT CATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTT ATGGTTCATTTAAATTTTCTCAATTTATCTGTACAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)