These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9646#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 986 fasta sequence [AGTTTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG-CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGATTAATACTGCCTCCTCCAACTACTTGTCAATTAACATATCAAGCTGATCGATTCAATTCTTCACTTAAGTACCTCGGCTGGCATAATTCTGATCAAACTGAT] [+] EMBL CD178551 [AGTTTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATACGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTTCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCT ] [-] EMBL CD120909 [ TTTTGCGCAACATGGGACTTGTTCGTCCTATTCGTATGATTCTTTGTTTTGTTTGTTTCTTGTTTCTCGTGAACTCTCAAAATGCACAGAAAGAACCCAGTTGCGGCCGTGCAAAAAGTTGTAGTGAATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTT ] [+] EMBL CD186858 [ ATGCATGGGGATACGCCCTGCCTGTTCGTGGTGTAGTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGCCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACGAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTT ] [+] EMBL CD164417 [ CGTGG GCACTGCTGATGAATTTGATGATACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAA ] [+] EMBL CD164415 [ ATTTGATGGTACGAAAGAAGGTCCAGGGTTTCGTTGTGCTCCATCTTCAGTCTTATTGGCCCGTGGATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGTTTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAA ] [+] EMBL CD180983 [ ATGTCCACAAAGTAGTATCGAGGATGTGGAGTCTGTGTTATTAGATCATGGAGTTCCTCTTGATCAAGCCAGTTTAACCGAAGATATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTACAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACca ] [-] EMBL CD146541 [ ATACAACTTACTCCACGATCACAATCAGTAAAGGTCAGACCCGGAGGGACTATGATGGTCAATTTCACATTCCAGTCTATTTCGGATTACCCCGTTGACCTTTATTTCTTAACAGATCTCAGTTATACAATGATTGATGATTTGGAAACAGTTTCTCGTTTGACTAACGATATTGTATTAACTATGCGTAATGTAACAAAAAAGTTACAAATGGGATTCGGTGCCTTTGTAGACAAACCAGTGTTTCCCTTTGTTGTGCCAACTCCAGAATATCTTCGAAATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACGTTTTGTCACTTAC ] [-] EMBL CD182584 [ ATCCATGTTTAAATGTTGGTACTAAAAATCTCCATTGCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCACTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGAT ] [-] EMBL CD163641 [ GCGATCCTCCATTCTTGTACAAACACATTTTGTCACTTACCGATAATTTTGAGGAGTTCAGAGAAAAAACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGGGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTG CCCGTAAAATCGTACTATTTGCTTCTGACGGTGGATTCCATTTGGCTGGTGATGGTCGAATCGCTGGATTAATACTGCCTCCTCCAACTACTTGTCAATTAACATATCAAGCTGATCGATTCAATTCTTCACTTAAGTACCTCGGCTGGCATAATTCTGATCAAACTGAT] [+] EMBL CD200334 [ AACCAAAGTAGCACGTCCTTCAGGTAATCTAGATAGTCCAGAGNGTGGTATGGACGCATTACTTCAGGTTGCCCGATGCAGTGAAGCTATTGGATGGCGTGCTGGTGCCCCGT AAATCGTACTATTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||