These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9752#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 800 fasta sequence [AGTCTTTTGATACACCTGTATTTCCTGAAGAATCTTCGGAACTTTTTACAGCAGAAATATCAACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA-GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAA-GCTCTTTTGAACGCGTCAGACGACCTACTATTTGC] [-] EMBL CD062328 [AGTCTTTTGATACACCTGTATTTCCTGAAGAATCTTCGGAACTTTTTACAGCAGAAATATCAACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTGATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAG ] [-] EMBL BF937038 [ ACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATctcgtgc ] [+] EMBL CD137642 [ TGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAANATAAGACCTANACTCTCTAGCCTCANAAACATGCTGAAAGAACTGTNTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGT AAAAAGTGAAGGGGAT ATCTTGAGTGG ] [+] EMBL CD098009 [ TTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTCGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTAACGACCACGAG ] [-] EMBL CD165085 [ GTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACAT ] [-] EMBL CD165147 [ TCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACAT ] [-] EMBL CD120529 [ GAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTC AAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGc ] [-] EMBL CD098086 [ cgGTCAATTCATAAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATAATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGACATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAATGCTCTTTTGAACGCGTCAGACGA ] [+] EMBL CD179022 [ GATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTAGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTGCAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAATGCTCTTTTGAACGCGTCAGACG ] [-] EMBL CD127544 [ GACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAA GCTCTTTTGAACGCGTCAGACGACCTACTATTTGC] [+] EMBL CD194965 [ TTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGACCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||